Le 29 avril 2003, la Police de l'État espagnol a arrêté à huit membres d'Udalbiltza à la demande du juge Baltazar Garzón : Miriam Campos, Eider Casanova, Lander Etxebarria, Oskar Goñi, Leire Idoiaga, Txema Jurado, Larraitz Sanzberro et Karmele Urbistondo. Après 24 heures les prisonniers ont déclaré devant le juge qui les a tous écroués. Entre temps, la Police de l'État espagnol a perquisitionné et a scellé les sièges d’Astigarraga, de Bilbo, Gasteiz et d'Iruñea, et y a réquisitionné le matériel trouvé. Ainsi, il a suspendu provisoirement l'activité d'Udalbiltza, en l'accusant d’être "un instrument d'ETA". Quant aux personnes arrêtées, il les a accusées d’être membre de l’ETA et, en suivant ses ordres, de promouvoir la création d'AuB et les plates-formes locales municipales.
Afin de faire face à l'attaque, des représentants d'Udalbiltza se sont réunis à la mairie d'Astigarraga avec des représentants du domaine politique, de l'activité culturelle basque, de la culture et des syndicats et divers acteurs sociaux en général. D'autre part, des élus de dizaines de communes ont procédé à une réunion d'urgence au fronton d'Astigarraga. Finalement, après deux ans et demi sans avoir tenu de réunion, les deux expressions d'Udalbiltza se sont réunies dans le but de promouvoir la coopération après l'opération policière.
Dans ce contexte, Maribi Ugarteburu, porte-parole d'Udalbiltza s'est adressée aux médias en soulignant la succession de faits : "Nous ne croyons pas au hasard, puisque l'opération policière a eu lieu 48 heures après qu'udalbiltza ait réaffirmé sa décision de continuer à travailler juste au moment où il faut décider de la présence d'une option politique aux élections "
À son avis, l'opération ordonnée par le juge espagnol Baltasar Garzón contre l'institution nationale "est un autre chapitre de la stratégie de guerre et d'attaque contre les basques".
Le maire d'Amoroto a affirmé que "C’était une opération annoncée. Bien qu'il ne nous accuse d'aucune infraction, le dossier de Garzón consacre 35 pages à l'activité d'Udalbiltza".
Finalement, Ugarteburu a voulu lancer un appel : "N'oublions pas qu'udalbiltza est intégré par davantage de personnes que de prisonniers. C'est une assemblée d’élus et, en ce sens, j’aimerais demander à tous qu’ils négligent les sigles, apprennent des coup durs et soutiennent tous ensemble Udalbiltza, pour qu’elle avance".
Grâce aux contacts pris, une manifestation nationale en Bilbo pour le 10 mai a été annoncée sous le slogan Bai Udalbiltzari, Bai Euskal Herriari.
Plusieurs centaines de représentants municipaux ont tenu une assemblée extraordinaire le 7 mai dans le Théâtre Leidor de Tolosa "pour lancer un appel à la dignité devant la situation politique grave".